หน่วยงานส่วนกลาง   กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร กลุ่มตรวจสอบภายใน สำนักบริหารกลาง   ส่วนประชาสัมพันธ์ ส่วนประสานราชการ ส่วนนิติการ ส่วนบริหารงานคลัง ส่วนบริหารงานบุคคล ส่วนระบบงานสารบรรณ สถาบันพัฒนาผู้สอบบัญชี สำนักพัฒนาการบัญชีเกษตรกร  สำนักมาตรฐานการสอบบัญชีภาคเอกชน สำนักนโยบายและมาตรฐาน    ส่วนติดตามและประเมินผล สำนักเทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร   กลุ่มอำนวยการ ส่วนระบบเครือข่ายและคอมพิวเตอร์ ส่วนระบบบัญชีและสอบบัญชีคอมพิวเตอร์ ส่วนระบบสารสนเทศและฐานข้อมูล กลุ่มตรวจข้อมูลและบริการสารสนเทศ ส่วนวิจัยและพัฒนาสารสนเทศทางการเงิน

สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ภูมิภาค สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 1   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์พระนครศรีอยุธยา สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์นนทบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ปทุมธานี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์อ่างทอง สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณลพบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สิงห์บุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สุพรรณบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์กาญจนบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์อุทัยธานี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ชัยนาท สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สระบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 2   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ชลบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ระยอง สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ฉะเชิงเทรา สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์จันทบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ตราด สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สระแก้ว สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ปราจีนบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สมุทรปราการ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์นครนายก สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 3   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์นครราชสีมา สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์บุรีรัมย์ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์มหาสารคาม สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ชัยภูมิ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สุรินทร์ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 4   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์อุบลราชธานี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ยโสธร สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ร้อยเอ็ด สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์มุกดาหาร สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์อำนาจเจริญ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์กาฬสินธุ์ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ศรีสะเกษ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 5   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์อุดรธานี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์เลย สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สกลนคร สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์หนองคาย สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์หนองบัวลำภู สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ขอนแก่น สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์นครพนม สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 6   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์พิษณุโลก สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์อุตรดิตถ์ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์พิจิตร สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์เพชรบูรณ์ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์นครสวรรค์ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์กำแพงเพชร สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ตาก สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สุโขทัย สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์แพร่ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์น่าน สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 7   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์เชียงใหม่ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์เชียงราย สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์พะเยา สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ลำปาง สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์แม่ฮ่องสอน สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ลำพูน สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 8   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์นครศรีธรรมราช สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์กระบี่ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สุราษฎร์ธานี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์พังงา สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ชุมพร สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ภูเก็ต สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ระนอง สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 9   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สงขลา สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์พัทลุง สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สตูล สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ปัตตานี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ยะลา สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ตรัง สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์นราธิวาส สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ที่ 10   สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์กรุงเทพมหานคร สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์เพชรบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ราชบุรี สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ประจวบคีรีขันธ์ สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์นครปฐม สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สมุทรสาคร สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สมุทรสงคราม